کبوترخانه میبد دارای پوسته‌ای عظیم خشتی با شش جرز داخلی می‌باشد و ورودی کوچکی در سمت غرب برج قرار دارد. بدنه‌های جرزها از حفره‌هایی به ابعاد ۲۰ در ۲۰ سانتی‌متر ساخته شده که هر یک آشیانه کبوتری می‌باشد.  چهار برجک و یک برج میانی بر روی سقف جهت ورود و خروج کبوتران قرار داشته و رنگ تند اخرایی مقرنس‌ها عامل جذب پرندگان بوده است.

کبوترخانه میبد حد فاصل مزارع سرسبز شمس آباد و رفیع‌ آباد قرار دارد. این برج که در حال حاضر به برج فرمانداری معروف است.

کبوترخانه‌ها دارای معماری منحصر به فرد و ویژه‌ای هستند که نشانگر اوج توانایی علمی، هنری و معماری مردم ایران بوده است. کبورترخانه ها از مهم ترین بناهای ایران در رابطه با کشاورزی سنتی بوده که صرفا به منظور تولید کود جهت تقویت زمین های کشاورزی ساخته می شدند.

از لحاط پراکندگی نیز، بیشتر کبوترخانه در استان اصفهان و مربوط به دوره های صفویه تا قاجار ساخته شدند.