در سال 1309 به همت استاد حسین طاهرزاده بهزاد از هنرمندان برجسته کشور این موزه در جهت حفظ و احیای ارزش اصیل هنرهای ملی و سنتی ایران تاسیس گردید. مکانی که نمایشگر هنرهای ملی، هویت فرهنگی و چندین هزار ساله‌‌ ایران است. آثار موزه شامل رشته‌ های گوناگون از جمله زربافی، گبه و فرش، خاتم‌ کاری، کاشی‌ کاری و نگارگری می باشد. آنچه بدون شک در ابتدای ورود به موزه توجه شما را به جلب می کند معماری چشم گیر و بی نظیر آن خواهد بود. قدمت آثار موزه در برخی موارد بلکه به قرن دوازده نیز بر می گردد. یکی از دیدنی ترین اشیای این موزه «منبر» منبتی است که هنرمندان ایرانی آن را برای مسجد مسلمانان هامبورگ ساختند.

ساختمان موزه در دوره فتحعلی شاه در جنوبی‌ ترین قسمت قصر و باغ نگارستان ساخته شد. این بنا با نام حوضخانه باغ نگارستان نیز شناخته می شود. در واقع ساختمان وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی در زمان قاحار باغ بزرگی بوده است و امروزه تنها حوضخانه آن به جا مانده است که تبدیل به موزه گردیده است. بنای موزه در فهرست آثار ملی ایران قرار دارد.